Türkiye’nin araştırmacı insan gücünü karşılayacak, sağlık alanında dışa bağımlılığı azaltan yenilikçi ürün ve teknolojilerin geliştirilmesini, bilime katkı sağlayan çalışmaların yürütülmesini sağlayan lisansüstü çalışmaları gerçekleştirmek amacıyla 2016 yılında Sağlık Bilimleri Üniversitesi’nde kurulan Sağlık Bilimleri Enstitüsü’nde toplam 51 Anabilim Dalı bulunmaktadır. Toplamda 40 yüksek lisans ve 41 Doktora programındaki eğitim, enstitü ve üniversitemize bağlı öğretim üyeleri ile yürütülmektedir. İstanbul’da merkezi konumda bulunması, alanında deneyimli ve donanımlı akademik kadroya sahip olmasından dolayı enstitümüz yüksek oranda tercih edilmektedir.

Türkiye genelinde çok sayıda hastane ile yapılan afiliasyonlar, merkezi araştırma merkezleri, anabilim dalları bünyesinde bulunan laboratuvarlar ve simülasyon merkezleri öğrencilere uygulama ve staj imkanları sağlamaktadır. Enstitümüzde bazı multidisipliner anabilim dallarında 1-2 dönem süren bilimsel hazırlık programları bulunmakta olup farklı bilimsel alanlarından gelen öğrencilere eğitim alma imkânı sağlanmaktadır. Erasmus, Mevlana gibi uluslararası, Farabi gibi ulusal işbirliği anlaşmaları ile öğrenciler farklı işbirliği içinde bulunan üniversitelerde bilimsel çalışma yapma fırsatı yakalamaktadır.

Üniversitemizde 2018 yılında kurulan Teknokent ile üniversite-sanayi işbirliği sağlanmakta, öğrenciler sağlık alanında sanayiye yönelik çalışmalar yürütebilmektedir. Lisansüstü çalışmalarını yürüten öğrencilerimiz, YÖK 100/2000, TÜBİTAK BİDEB yurtiçi lisansüstü/doktora burslarından ve çeşitli vakıfların vermiş olduğu burs imkanlarından yararlanabilmektedir. Çalışmalarını başarı ile tamamlayan mezunlarımız hastaneler, özel sektör, üniversite gibi farklı çalışma alanlarında tercih edilmekte, geniş iş olanaklarından yararlanabilmektedir.